CoalescentSTR

CoalescentSTRはハイスループットシークエンスデータから
複数人のマイクロサテライトにおけるリピート数を推定するための手法です。
Coalescent理論を用いることで複数人のデータを一つの統計モデルとして扱うことを可能とし、
リード長よりマイクロサテライト領域についても高精度にリピート数を推定することができます。

※引用について
このソフトウェアに関連した引用は以下の論文になります。


K. Kojima, Y. Kawai, N. Nariai, T. Mimori, T. Hasegawa and M.
Nagasaki. Short tandem repeat number estimation from paired-end
sequence reads by considering unobserved genealogy of multiple
individuals. Proc. 11th International Symposium on Bioinformatics
Research and Applications, volume 9096 of Lecture Notes in Computer
Science, pp.422-423, Springer Berlin Heidelberg, 2015.